MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp6

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021228	GCG	2	6	1063	1068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148318
2	NC_021228	AAG	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148318
3	NC_021228	ACC	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148318
4	NC_021228	TCA	3	9	1213	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
5	NC_021228	TAA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
6	NC_021228	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
7	NC_021228	GTT	2	6	1305	1310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
8	NC_021228	CTTCC	2	10	1364	1373	0 %	40 %	0 %	60 %	501148318
9	NC_021228	TTA	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
10	NC_021228	T	6	6	1428	1433	0 %	100 %	0 %	0 %	501148318
11	NC_021228	TCT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
12	NC_021228	CAT	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
13	NC_021228	AGT	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148318
14	NC_021228	CTTT	2	8	1612	1619	0 %	75 %	0 %	25 %	501148318
15	NC_021228	GAA	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148318
16	NC_021228	GTT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
17	NC_021228	CAG	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
18	NC_021228	TCT	2	6	1786	1791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
19	NC_021228	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
20	NC_021228	AAAG	2	8	1809	1816	75 %	0 %	25 %	0 %	501148318
21	NC_021228	ATTGA	2	10	1923	1932	40 %	40 %	20 %	0 %	501148318
22	NC_021228	TCCA	2	8	1976	1983	25 %	25 %	0 %	50 %	501148318
23	NC_021228	CAA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
24	NC_021228	TAC	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
25	NC_021228	ATCAAC	2	12	2145	2156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501148318
26	NC_021228	CTTG	2	8	2234	2241	0 %	50 %	25 %	25 %	501148318
27	NC_021228	TTC	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
28	NC_021228	GCT	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148318
29	NC_021228	AGC	2	6	2430	2435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
30	NC_021228	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
31	NC_021228	CAG	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
32	NC_021228	AGG	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148318
33	NC_021228	AAT	2	6	2652	2657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
34	NC_021228	ATA	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
35	NC_021228	ACTG	2	8	2758	2765	25 %	25 %	25 %	25 %	501148318
36	NC_021228	TGT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
37	NC_021228	CCA	2	6	2887	2892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148318
38	NC_021228	AAAC	2	8	2900	2907	75 %	0 %	0 %	25 %	501148318
39	NC_021228	CAA	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
40	NC_021228	ATA	2	6	2932	2937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
41	NC_021228	T	7	7	2979	2985	0 %	100 %	0 %	0 %	501148318
42	NC_021228	CAG	3	9	2996	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
43	NC_021228	TAG	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148318
44	NC_021228	ATT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
45	NC_021228	AAC	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
46	NC_021228	TTA	2	6	3112	3117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
47	NC_021228	TTG	2	6	3283	3288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
48	NC_021228	CATA	2	8	3321	3328	50 %	25 %	0 %	25 %	501148318
49	NC_021228	TGT	2	6	3343	3348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
50	NC_021228	TTG	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148319
51	NC_021228	TTG	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148319
52	NC_021228	TATC	2	8	3824	3831	25 %	50 %	0 %	25 %	501148319
53	NC_021228	ATAA	2	8	3835	3842	75 %	25 %	0 %	0 %	501148319
54	NC_021228	TGT	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148320
55	NC_021228	T	7	7	4098	4104	0 %	100 %	0 %	0 %	501148320
56	NC_021228	TCA	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148320
57	NC_021228	TAC	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148320
58	NC_021228	CAA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148321
59	NC_021228	AAG	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148321
60	NC_021228	AAT	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148321
61	NC_021228	CGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148321
62	NC_021228	GCTAC	2	10	4490	4499	20 %	20 %	20 %	40 %	501148321
63	NC_021228	A	7	7	4586	4592	100 %	0 %	0 %	0 %	501148321
64	NC_021228	TGT	2	6	4641	4646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148321
65	NC_021228	GCT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148321
66	NC_021228	TTCC	2	8	4692	4699	0 %	50 %	0 %	50 %	501148321
67	NC_021228	ATTA	2	8	4775	4782	50 %	50 %	0 %	0 %	501148321
68	NC_021228	TTGGT	2	10	4848	4857	0 %	60 %	40 %	0 %	501148321
69	NC_021228	TTA	2	6	4865	4870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148321
70	NC_021228	CAAG	2	8	4916	4923	50 %	0 %	25 %	25 %	501148321
71	NC_021228	GTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148322
72	NC_021228	T	6	6	5180	5185	0 %	100 %	0 %	0 %	501148322
73	NC_021228	AC	3	6	5202	5207	50 %	0 %	0 %	50 %	501148322
74	NC_021228	AAC	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148322
75	NC_021228	A	7	7	5236	5242	100 %	0 %	0 %	0 %	501148322
76	NC_021228	CAAA	2	8	5266	5273	75 %	0 %	0 %	25 %	501148322
77	NC_021228	TTTC	2	8	5298	5305	0 %	75 %	0 %	25 %	501148322
78	NC_021228	A	8	8	5404	5411	100 %	0 %	0 %	0 %	501148323
79	NC_021228	TGA	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148323
80	NC_021228	TGCT	2	8	5434	5441	0 %	50 %	25 %	25 %	501148323
81	NC_021228	TGA	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148323
82	NC_021228	A	6	6	5545	5550	100 %	0 %	0 %	0 %	501148323
83	NC_021228	AAG	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148323
84	NC_021228	ATT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148323
85	NC_021228	GAAAT	2	10	6315	6324	60 %	20 %	20 %	0 %	501148324
86	NC_021228	ATTT	2	8	6387	6394	25 %	75 %	0 %	0 %	501148324
87	NC_021228	T	7	7	6392	6398	0 %	100 %	0 %	0 %	501148324
88	NC_021228	ATT	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148324
89	NC_021228	A	6	6	6528	6533	100 %	0 %	0 %	0 %	501148324
90	NC_021228	T	6	6	6584	6589	0 %	100 %	0 %	0 %	501148324
91	NC_021228	AGA	2	6	6625	6630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
92	NC_021228	AGT	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148324
93	NC_021228	AGA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
94	NC_021228	T	6	6	6809	6814	0 %	100 %	0 %	0 %	501148324
95	NC_021228	AGA	2	6	6889	6894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
96	NC_021228	A	7	7	6928	6934	100 %	0 %	0 %	0 %	501148324
97	NC_021228	AGAAA	2	10	6988	6997	80 %	0 %	20 %	0 %	501148324
98	NC_021228	GC	3	6	7093	7098	0 %	0 %	50 %	50 %	501148324
99	NC_021228	A	7	7	7175	7181	100 %	0 %	0 %	0 %	501148324
100	NC_021228	CAAG	2	8	7190	7197	50 %	0 %	25 %	25 %	501148324
101	NC_021228	AAG	2	6	7200	7205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
102	NC_021228	TGA	2	6	7265	7270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148325
103	NC_021228	CAA	2	6	7345	7350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148325
104	NC_021228	GTTGAT	2	12	7368	7379	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501148325
105	NC_021228	TCA	2	6	7416	7421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148325
106	NC_021228	CAA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148325
107	NC_021228	GAT	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148325
108	NC_021228	GAC	2	6	7452	7457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148325
109	NC_021228	A	6	6	7461	7466	100 %	0 %	0 %	0 %	501148325
110	NC_021228	AAAG	2	8	7532	7539	75 %	0 %	25 %	0 %	501148325
111	NC_021228	CAA	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148325
112	NC_021228	ACAA	2	8	7585	7592	75 %	0 %	0 %	25 %	501148325
113	NC_021228	GAA	2	6	7599	7604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148325
114	NC_021228	ATA	2	6	7654	7659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148325
115	NC_021228	AAG	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148325
116	NC_021228	ACAA	2	8	7681	7688	75 %	0 %	0 %	25 %	501148325
117	NC_021228	AACCTA	2	12	7720	7731	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501148325
118	NC_021228	GTG	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148325
119	NC_021228	CGAA	2	8	7991	7998	50 %	0 %	25 %	25 %	501148326
120	NC_021228	T	6	6	8087	8092	0 %	100 %	0 %	0 %	501148326
121	NC_021228	ATT	2	6	8096	8101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148326
122	NC_021228	TCA	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148326
123	NC_021228	ATC	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148327
124	NC_021228	TCT	2	6	8155	8160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148327
125	NC_021228	GTT	2	6	8295	8300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148327
126	NC_021228	TTC	2	6	8423	8428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148327
127	NC_021228	CATC	2	8	8437	8444	25 %	25 %	0 %	50 %	501148327

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.